穿山甲是新型冠状病毒潜在中间宿主?专家观点不一
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(原标题:穿山甲是新型冠状病毒的潜在中间宿主?专家观点不一) 新京报讯(记者 李玉坤)自2月7日,华南农业大学研究人员宣称穿山甲为新型冠状病毒的潜在中间宿主之后,关于“穿山甲中间宿主论”的关注持续升温。科技部社会发展科技司司长吴远彬15日也表示,正组织有关科研团队进行论证,对新冠病毒从穿山甲到人的传播也在进一步加紧研究。 近日,4篇与穿山甲冠状病毒相关的论文手稿发表在生物学论文预发布平台bioRxiv,分别是香港大学教授管轶等人的论文dentification of 2019-nCoV related coronaviruses in Malayan pangolins in southern China(华南地区马来亚穿山甲中2019-nCoV相关冠状病毒的鉴定),华南农业大学教授沈永义等人论文Isolation and Characterization of 2019-nCoV-like Coronavirus from Malayan Pangolins(马来亚穿山甲中新冠类似病毒的分离与鉴定),以及广东省生物资源应用研究所研究院陈金平等人的论文Are pangolins the intermediate host of the 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) ?(穿山甲是新冠病毒的中间宿主吗?)以及Matthew C. Wong等人在2月7日提交的Evidence of recombination in coronaviruses implicating pangolin origins of nCoV-2019(冠状病毒重组的证据表明新冠病毒来源于穿山甲)。 中国的三篇论文都分析了从穿山甲身体发现的冠状病毒与人类流行的新冠病毒的基因序列相似性,管轶和沈永义的论文认为穿山甲有很大可能是新冠病毒的中间宿主,陈金平的论文则提出了一些疑点。此外,一些专家也在线发文,提出了自己的看法。 证据1: 穿山甲冠状病毒和新冠病毒9成相似 华南农大在2月7日的发布会时称,通过对病毒的基因组分析,发现从穿山甲身上分离的冠状病毒病毒株与目前感染人的毒株序列相似度高达99%。 但从近日提交的论文来看,研究者从多个样本中获得了一个接近完成的冠状病毒基因组(29,578 bp),其中E、M、N和S基因中分别与2019-nCoV(新冠病毒)表现出100%, 98.2%,96.7%和90.4%的氨基酸同一性。S,E,M和N4个基因的长度分别为3798、228、669和1260 bp(碱基对),以此来看,也并非全基因序列上达到了99%。 华南农大的论文指出,在全基因组序列分析中,穿山甲冠状病毒基因组在整个基因组中与人类新冠病毒和一株蝙蝠SARS相关冠状病毒(Bat SARSr-CoV RaTG13)非常相似,除S基因外,序列同一性在80%至98%之间。 管轶论文中,推测穿山甲冠状病毒基因组与新冠病毒有85.5%至92.4%的相似性。陈金平等人的研究显示,穿山甲冠状病毒和新冠病毒之间的核苷酸序列同一性为90.23%,单个蛋白的序列同一性最高可达100%。穿山甲冠状病毒和蝙蝠SARS相关冠状病毒(Bat SARSr-CoV RaTG13)之间的核苷酸序列相似性为90.15%。 三组研究的结论都能证明,穿山甲冠状病毒与新冠病毒和一组蝙蝠冠状病毒遗传相关。 根据论文说明,记者发现,三组研究所使用的穿山甲并非完全同一批,但广东部分来自同一批海关缉私行动。华南农业大学从2019年3月至12月从野生动植物救援中心收集的四只中华穿山甲 (Manis pentadactyla)和25只马来亚穿山甲(Manis javanica)获得了肺组织,但中华穿山甲的样本没有能够扩增。管轶研究的穿山甲样品,大部分是2017年8月至2018年1月广西海关在反走私行动中获得的。 证据2 二者的受体结合域非常相似 华南农大的论文特别指出,穿山甲冠状病毒的S蛋白的受体结合结构域实际上与人类新冠病毒的S蛋白受体结构域相同,只是具有一个氨基酸差异。陈金平等人的论文解释,冠状病毒的S蛋白通过受体结合域(RBD)与宿主受体结合,并在引发病毒感染和确定宿主嗜性中起重要作用。 先前的研究表明,新冠病毒,SARS病毒和蝙蝠中发现的冠状病毒具有相似的受体结合域,表明它们都使用相同的受体ACE2,与MERS病毒的受体结构域不同。“我们的分析表明,穿山甲冠状病毒与这三种病毒的受体结合域更一致,这表明穿山甲CoV很可能使用ACE2作为受体。另一方面,ACE2受体存在于穿山甲中,与人体内的基因同源物序列高度一致。但是,尚不清楚这种穿山甲冠状病毒的人畜共患病情况。”陈金平等人在论文中分析。 论文具体分析,通过对在人类、穿山甲、果子狸、蝙蝠这4种动物中发现的SARS相关冠状病毒的S蛋白进行比较分析,SARS病毒的S蛋白的受体结合域可以有效地结合人和果子狸的ACE2,另外,它似乎能够结合穿山甲的ACE2, 蝙蝠毒株(Bat-CoV-RaTG13)也是如此。 相反,新冠病毒和穿山甲冠状病毒的S蛋白可能仅识别人和穿山甲的ACE2。 因此,人和穿山甲的ACE2可能可以识别所有四种SARS相关冠状病毒的S蛋白,而果子狸的ACE2只能可靠地识别SARS病毒和蝙蝠冠状病毒(Bat-CoV-RaTG13)的S蛋白。 管轶等人也在论文中分析,受体结合域方面,新冠病毒与广东穿山甲中发现的冠状病毒表现出非常高的序列相似性。 Joe Petrosino课题组的成员Matthew Wong21天前就在病毒学网站上发帖称,武汉新冠病毒株的刺突蛋白(spike protein,或者翻译为长钉蛋白、穗蛋白,就是冠状病毒的“皇冠尖”,文中所说的受体结合域就在刺突蛋白上,负责和受体结合,让病毒进入细胞。——记者注)总体上更接近蝙蝠病毒株(RaTG13),这可能是由于穿山甲冠状病毒的S蛋白的某个亚结构域非常不同,但是从某一部分( S1-CTD )开始,武汉株新冠病毒和穿山甲冠状病毒受体结合结构域非常相似,大约97%。 Matthew Wong等人的论文显示,从新冠病毒的受体结合域组成看,蝙蝠株病毒(RaTG13)基因组仅共享参与受体结合基序的五个关键氨基酸中的一个,而穿山甲冠状病毒则共享所有五个关键残基。 似乎在穿山甲中发现的冠状病毒株与蝙蝠病毒株之间的重组中产生了新冠病毒的受体结合域。但是管轶等人并不倾向于发生了重组,而是认为产生了趋同进化。 证据3 穿山甲冠状病毒具有感染人类的潜力 虽然陈金平团队的研究数据不支持直接从穿山甲冠状病毒演变而成新冠病毒,但这项研究表明穿山甲是Beta冠状病毒(SARS/新冠病毒都属于这一类——记者注)的天然宿主,具有感染人类的潜力。 研究显示,从两个不同的海关在不同的日期截获的两批穿山甲中检测到的冠状病毒的基因组序列都与蝙蝠冠状病毒有关。尽管不清楚这两批走私的穿山甲是否是来自同一地区,但能够表明穿山甲是βeta冠状病毒的天然宿主,可能与穿山甲共生。陈金平等人研究中检测到的全部三只穿山甲都被Beta冠状病毒感染,病情很重,患有严重的呼吸道疾病,目前尚不清楚该冠状病毒是否为常见病毒穿山甲呼吸道中的菌群,这种冠状病毒对穿山甲的发病机理仍有待研究。 (编辑:52刷机网) 【声明】本站内容均来自网络,其相关言论仅代表作者个人观点,不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利,请及时与联系站长删除相关内容! |
