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穿山甲是新型冠状病毒潜在中间宿主?专家观点不一

发布时间:2020-02-23 15:13:28 所属栏目:通讯 来源:网络整理
导读:穿山甲是新型冠状病毒潜在中间宿主?专家观点不一

陈金平等人认为,他们的研究结果不能防止其他冠状病毒可能在穿山甲中传播,对穿山甲中冠状病毒的大量监测可以增进人们对穿山甲中冠状病毒谱的了解。保护野生生物和限制人类和野生生物的接触,才能将冠状病毒从野生动物传播给人类的风险降到最低。

赵素文也谈到,穿山甲在野外基本是独居的,即使生病,也不易引发大流行。而活穿山甲在走私过程中,经常多只一起走私,由于环境恶劣,很容易得肺病并互相传染,所以穿山甲冠状病毒具备在被走私的穿山甲群体中长期流行的条件。

疑点1

中间宿主相似性比原生宿主低?

但记者发现,9成左右的相似,远低于新冠病毒与在蝙蝠身上发现的冠状病毒相似性。中科院武汉病毒研究所及华中农业大学研究证实,新冠病毒与一个云南的蝙蝠样本中发现的冠状病毒相似度高达96%。(即上文所述的Bat-CoV-RaTG13,该蝙蝠定居在距武汉近2000公里的云南省)

与SARS病毒的传播相比,这种情况不太合理。2017年,中国科学院武汉病毒研究所确定了SARS病毒的原生宿主是菊头蝠,此前认为的果子狸只是中间宿主。基因测序发现,果子狸体内检测到的SARS相关冠状病毒,与人群中流行的SARS病毒全基因组序列的一致性达到99.8%,两者高度相关。一株蝙蝠冠状病毒全长基因组测序证明,与能够感染人和果子狸的SARS冠状病毒,基因组序列相似度为92%。

上海科技大学iHuman研究所研究员赵素文指出,论起和新冠病毒的亲疏远近,还是蝙蝠冠状病毒RaTG13排第一,穿山甲冠状病毒目前屈居第二。

陈金平等人在论文中则直接指出,穿山甲冠状病毒与新冠病毒之间存在高度序列相似性,但是,系统发育分析不支持直接从穿山甲冠状病毒中产生的冠状病毒。

疑点2

新冠病毒特有的Furin蛋白酶切位点

Matthew Wong此前已经提到了,穿山甲冠状病毒和新冠病毒的受体结合域非常相似,但新冠病毒多了一个Furin蛋白酶切位点。

南开大学高山等人2020年2月2日提交在中科院预印本ChinaXiv网站的论文手稿《武汉2019冠状病毒S蛋白可能存在Furin蛋白酶切位点》在国际上首次报道一个重要的变异,这个变异引入了一个可供Furin蛋白酶切的位点,是此前所有发现的SARS和 SARS类似(SARS-like)冠状病毒所不具备的,这种变异有可能增强了武汉2019冠状病毒的传播能力。

作者称,在前期工作基础上,无意间发现了武汉2019冠状病毒基因组可能存在Furin蛋白酶切位点。这一发现暗示了武汉2019冠状病毒可能在感染途径上与SARS冠状病毒有较大差异,该病毒可能采用了HIV、鼠肝炎冠状病毒等其他病毒的包装机制,而不同于SARS等其他大部分Beta冠状病毒,由于包装机制的改变,武汉2019冠状病毒 S蛋白获得了更高的侵染细胞的效率,这可能是其传播能力大于 SARS 冠状病毒的一个原因。此外,一些禽流感病毒也可以通过突变获得一个 Furin蛋白酶切位点,以提高其侵染细胞的效率。

宾夕法尼亚大学医学院微生物学系副研究员李懿泽对此有过评论,他认为新冠病毒比其他亲缘近的病毒多了Furin切割位点,它的受体结合区与整体基因组亲缘更近蝙蝠冠状病毒的相似度还不如整体亲缘更远的穿山甲冠状病毒,如果完全通过自然进化获得这些独特性,非常不可思议。

赵素文也认为,穿山甲冠状病毒的刺突蛋白,不像新冠病毒那样有Furin酶切位点的加持。从新闻报道中的图片可以看到,广东的专家们在参与穿山甲救治时仅戴了手套,没有口罩,没有护目镜,更没有防护服,而我们知道广州并没有暴发疫情,显然这种穿山甲病毒,并没有新冠病毒那么具有传染性。从入境就被截获这一点来看,可以推测这批穿山甲应该入境前(越南)就携带上冠状病毒了。管轶团队从广西海关截获的多批穿山甲样本里也检测到了类似的冠状病毒,也证明了这一点。

遗憾:华南市场没有动物采样

虽然最开始武汉不明原因的肺炎的源头指向华南海鲜市场,但是最近的研究成果越来越不支持这一结论。

中科院西双版纳热带植物园副研究员郁文彬等人的论文基于全基因组数据解码新型冠状病毒进化和传播分析,与华南海鲜市场有关联的患者样品都是一个单倍型(并且不是最古老的单倍型)及其衍生的单倍型,现在样本中出现了只有一个来自武汉,与华南市场没有联系,这种单倍型在其他国家和地区的样本中出现,甚至部分国家新冠病毒单倍型在武汉的取样中没有发现。

他们分析,最早可能于去年11月中下旬,受感染的人很可能将新冠病毒传播给市场上的工人或卖家,然后迅速在市场上流通。

不过,华南市场出售野生动物的商铺阳性样本集中,在1月1日市场被责令休市前后,商铺的老板也有多例确诊。

中疾控病毒病所消息显示,他们于1月1日上午8时赴华南海鲜城,针对病例相关商户及相关街区集中采集环境样本515份,1月12日,病毒病所专家再次在华南海鲜市场采集野生动物贩卖商铺相关标本70份。这585份环境样本中,检测到33份样品含有新型冠状病毒核酸,并成功在阳性环境标本中分离病毒,提示该病毒来源于华南海鲜市场销售的野生动物。

中疾控报告称,华南海鲜市场西区存在野生动物交易,尤其是西区的七街和八街靠近市场内部的区域存在多家野生动物交易商铺,而这一区域的阳性标本也比较集中,占全部阳性样本的42.4%(14/33)。综上所述,高度怀疑此次疫情与野生动物交易有关。

遗憾的是,从目前的报道来看,相关机构只取了环境样本,并没有对动物取样,市场已经经过多次消毒。对此,管轶接受媒体采访时表示,华南海鲜市场封掉、洗地,“犯罪现场”都没了,很难破案。他表示,追溯动物源是个比较复杂的过程,不可能随便找到一个带有病毒的动物就把它归咎是元凶。

陈金平等人也在论文中指出,控制疾病传播的重要一点是确定新冠病毒的动物来源。在武汉这个生鲜市场(wet market)中,环境样本报告了高病毒载量。但是,在这个市场上出售了各种动物,包括一些野生动物,并且数量和种类都非常动态,尚不清楚哪个动物开始了第一次感染。

新京报记者 李玉坤

(编辑:52刷机网)

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